Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF10P50591 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF10P50591 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms