Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GSK3BP49841 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms