Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTPAP49638 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTPAP49638 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTPAP49638 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTPAP49638 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTPAP49638 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTPAP49638 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTPAP49638 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTPAP49638 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTPAP49638 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTPAP49638 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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