Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HARS2P49590 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HARS2P49590 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HARS2P49590 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HARS2P49590 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HARS2P49590 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HARS2P49590 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HARS2P49590 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HARS2P49590 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HARS2P49590 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HARS2P49590 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HARS2P49590 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms