Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNTBP49356 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNTBP49356 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNTBP49356 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTBP49356 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTBP49356 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTBP49356 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTBP49356 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTBP49356 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTBP49356 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTBP49356 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTBP49356 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTBP49356 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTBP49356 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms