Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNTAP49354 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FNTAP49354 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTAP49354 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTAP49354 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTAP49354 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTAP49354 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNTAP49354 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FNTAP49354 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNTAP49354 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNTAP49354 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNTAP49354 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNTAP49354 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FNTAP49354 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNTAP49354 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms