Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LSSP48449 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LSSP48449 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LSSP48449 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSSP48449 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSSP48449 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LSSP48449 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LSSP48449 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LSSP48449 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSSP48449 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSSP48449 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms