Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGRP47804 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGRP47804 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGRP47804 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGRP47804 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGRP47804 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGRP47804 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGRP47804 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms