Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSOP43234 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSOP43234 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSOP43234 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSOP43234 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSOP43234 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSOP43234 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSOP43234 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSOP43234 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSOP43234 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTSOP43234 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTSOP43234 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTSOP43234 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms