Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACAA2P42765 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA2P42765 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms