Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA2P42262 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms