Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR1BP42025 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms