Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBL1P41271 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBL1P41271 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBL1P41271 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBL1P41271 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBL1P41271 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBL1P41271 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBL1P41271 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms