Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX19P40855 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX19P40855 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX19P40855 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX19P40855 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX19P40855 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX19P40855 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX19P40855 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX19P40855 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX19P40855 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX19P40855 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms