Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBRP36941 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBRP36941 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBRP36941 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LTBRP36941 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBRP36941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBRP36941 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBRP36941 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBRP36941 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBRP36941 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBRP36941 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBRP36941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBRP36941 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBRP36941 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBRP36941 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBRP36941 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBRP36941 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBRP36941 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBRP36941 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBRP36941 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms