Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5C1P36542 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms