Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJC1P36383 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJC1P36383 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJC1P36383 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJC1P36383 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJC1P36383 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJC1P36383 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJC1P36383 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms