Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFC1P35251 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFC1P35251 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC1P35251 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC1P35251 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC1P35251 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFC1P35251 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFC1P35251 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFC1P35251 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFC1P35251 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFC1P35251 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFC1P35251 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms