Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSP1P33241 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSP1P33241 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSP1P33241 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSP1P33241 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSP1P33241 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSP1P33241 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSP1P33241 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSP1P33241 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LSP1P33241 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSP1P33241 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSP1P33241 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSP1P33241 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSP1P33241 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSP1P33241 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSP1P33241 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSP1P33241 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSP1P33241 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSP1P33241 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms