Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIPP30301 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIPP30301 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIPP30301 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIPP30301 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIPP30301 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIPP30301 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIPP30301 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIPP30301 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIPP30301 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIPP30301 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIPP30301 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms