Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD6P30203 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD6P30203 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD6P30203 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD6P30203 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD6P30203 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD6P30203 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD6P30203 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD6P30203 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD6P30203 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD6P30203 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD6P30203 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD6P30203 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD6P30203 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD6P30203 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD6P30203 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD6P30203 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms