Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PMLP29590 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMLP29590 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMLP29590 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMLP29590 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMLP29590 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMLP29590 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMLP29590 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMLP29590 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMLP29590 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMLP29590 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMLP29590 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMLP29590 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMLP29590 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms