Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP1P29466 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP1P29466 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP1P29466 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP1P29466 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP1P29466 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP1P29466 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms