Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL4A5P29400 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A5P29400 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms