Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTGFP29279 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CTGFP29279 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTGFP29279 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTGFP29279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTGFP29279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTGFP29279 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTGFP29279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTGFP29279 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTGFP29279 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTGFP29279 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTGFP29279 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTGFP29279 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTGFP29279 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTGFP29279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTGFP29279 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTGFP29279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTGFP29279 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTGFP29279 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CTGFP29279 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTGFP29279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTGFP29279 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTGFP29279 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms