Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD34P28906 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD34P28906 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD34P28906 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD34P28906 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD34P28906 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD34P28906 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD34P28906 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD34P28906 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD34P28906 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms