Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFS1P28331 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFS1P28331 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFS1P28331 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms