Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POU1F1P28069 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POU1F1P28069 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms