Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB2P26583 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMGB2P26583 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms