Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
DNMT1P26358 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DNMT1P26358 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms