Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGA3P26006 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA3P26006 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms