Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKBIAP25963 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms