Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRDP23468 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRDP23468 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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