Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYF6P23409 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYF6P23409 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYF6P23409 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYF6P23409 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYF6P23409 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYF6P23409 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYF6P23409 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYF6P23409 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYF6P23409 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYF6P23409 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYF6P23409 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYF6P23409 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYF6P23409 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms