Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR3P22607 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms