Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNB1P20700 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMNB1P20700 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms