Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PVALBP20472 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PVALBP20472 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PVALBP20472 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PVALBP20472 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PVALBP20472 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PVALBP20472 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PVALBP20472 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PVALBP20472 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PVALBP20472 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms