Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6AP20340 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6AP20340 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms