Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFE3P19532 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFE3P19532 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFE3P19532 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFE3P19532 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFE3P19532 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFE3P19532 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms