Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD53P19397 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD53P19397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD53P19397 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD53P19397 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD53P19397 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD53P19397 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD53P19397 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD53P19397 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD53P19397 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD53P19397 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD53P19397 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD53P19397 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms