Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2EP19388 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms