Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF6P18850 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF6P18850 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF6P18850 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATF6P18850 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATF6P18850 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF6P18850 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF6P18850 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATF6P18850 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATF6P18850 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATF6P18850 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF6P18850 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms