Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XBP1P17861 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XBP1P17861 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XBP1P17861 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XBP1P17861 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XBP1P17861 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XBP1P17861 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XBP1P17861 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XBP1P17861 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XBP1P17861 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XBP1P17861 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XBP1P17861 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XBP1P17861 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XBP1P17861 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XBP1P17861 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XBP1P17861 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
XBP1P17861 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XBP1P17861 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XBP1P17861 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms