Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOT1P17174 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOT1P17174 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOT1P17174 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOT1P17174 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOT1P17174 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms