Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF3P15923 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF3P15923 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF3P15923 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF3P15923 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF3P15923 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF3P15923 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF3P15923 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF3P15923 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF3P15923 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF3P15923 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF3P15923 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF3P15923 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF3P15923 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF3P15923 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF3P15923 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF3P15923 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms