Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAG1P15918 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAG1P15918 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAG1P15918 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAG1P15918 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAG1P15918 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG1P15918 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAG1P15918 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG1P15918 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG1P15918 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG1P15918 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG1P15918 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms