Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXB3P14651 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB3P14651 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms