Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCP1P13796 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCP1P13796 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCP1P13796 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCP1P13796 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCP1P13796 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCP1P13796 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCP1P13796 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCP1P13796 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCP1P13796 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCP1P13796 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCP1P13796 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms