Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAM1P13591 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCAM1P13591 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAM1P13591 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms