Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GP1BBP13224 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms